El acervo histórico de la Universidad de Guadalajara se divide en seis secciones: Archivos y mapoteca, Biblioteca Álvarez del Castillo, Periódicos, Publicaciones seriadas, Acervo General, Fondos especiales y un apartado especial de contenidos audiovisuales. 

Cada sección está dividida en subcategorías, que a su vez albergan su propio catálogo especializado.