La biblioteca Fray Francisco de Burgoa de la UABJO cuenta con un amplio repertorio para consulta digital. Alberga tres colecciones divididas cronológicamente, y un repositorio digital donde se exhiben tres colecciones más pequeñas sobre acontecimientos históricos concretos en Oaxaca.

Por último, cuenta con un apartado de proyectos interinstitucionales, donde se encuentran los convenios y colaboraciones que ha estabecido la UABJO con otras colecciones digitales.